Evaluación de la sensibilidad y especificidad de los métodos metagenómicos en el estudio etiológico de las neumonías en adultos inmunocompetentes, inmunocomprometidos y/o frágiles (PI24/00383)

Investigador/a principal (IP): Javier Sánchez Céspedes. Co-Investigador/a principal (Co-IP): Manuela Aguilar Guisado

Hospital Universitario Virgen del Rocío / Instituto de Biomedicina de Sevilla

OBJETIVOS:

General:

El objetivo general de este proyecto es evaluar la mNGS como una nueva técnica en el diagnóstico etiológico de la neumonía en adultos inmunocompetentes, inmunodeprimidos y/o frágiles, analizando su sensibilidad y especificidad, así como identificar nuevas etiologías de la neumonía adquirida en la comunidad y/o relacionada con la asistencia sanitaria en estos pacientes.

Específicos:

1. Reclutar una cohorte prospectiva de adultos inmunocompetentes, inmunodeprimidos y/o frágiles, con ingreso hospitalario por neumonía en áreas de hospitalización convencional y/o en cuidados intensivos, en los que se dispondrá de muestras de sangre, frotis nasofaríngeo y esputo representativo para su análisis utilizando métodos metagenómicos(mNGS) y moleculares basados en la PCR, además de los estudios clínicos convencionales para el diagnóstico etiológico.
2. Evaluar la sensibilidad y especificidad de la mNGS, comparada con los hemocultivos y la RT-PCR múltiple, para la detección en sangre, esputo y en frotis nasofaríngeo de bacterias, virus, otros organismos con requerimientos especiales para el crecimiento y patógenos no conocidos causantes de neumonía en adultos.
3. Conocer la prevalencia real de los diferentes patógenos respiratorios como agentes etiológicos de la neumonía en adultos inmunocompetentes, inmunocomprometidos y/o frágiles, y según el sexo.
4. Describir nuevos agentes etiológicos, actualmente no conocidos, de la neumonía en adultos inmunocompetentes, inmunocomprometidos y/o frágiles, y según el sexo.
5. Determinar la frecuencia de coinfección virus-virus, virus-bacterias u otros agentes en la etiología de la neumonía en adultos inmunocompetentes, inmunocomprometidos y/o frágiles.

Para recibir más información o solicitar participación contactar con IP : Javier Sánchez Céspedes, jsanchez-ibis@us.es Co-IP : Manuela Aguilar Guisado, maguilar12@us.es / maguilarguisado@yahoo.es